Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZBED8Q8IZ13 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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