Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NELFCDQ8IXH7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NELFCDQ8IXH7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NELFCDQ8IXH7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms