Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTU1Q7Z7A3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTU1Q7Z7A3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTU1Q7Z7A3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTU1Q7Z7A3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTU1Q7Z7A3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms