Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR88Q6ZMY6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
WDR88Q6ZMY6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms