Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRNIPQ6NTE8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRNIPQ6NTE8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRNIPQ6NTE8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms