Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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