Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSTF3Q12996 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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