Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms