Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE1BQ01064 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDE1BQ01064 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms