Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAPPC10P48553 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC10P48553 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms