Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNFP41002 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNFP41002 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCNFP41002 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCNFP41002 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCNFP41002 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNFP41002 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNFP41002 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNFP41002 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNFP41002 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNFP41002 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNFP41002 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNFP41002 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNFP41002 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNFP41002 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNFP41002 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNFP41002 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNFP41002 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNFP41002 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNFP41002 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNFP41002 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNFP41002 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNFP41002 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNFP41002 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNFP41002 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNFP41002 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCNFP41002 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNFP41002 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNFP41002 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms