Protein–RNA interactions for Protein: P40318

SSM4, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase DOA10, yeastyeast

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Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSM4P40318 SWI1YPL016W 3945 nt5.84□□□□□ -1.47
SSM4P40318 PDE1YGL248W 1110 nt5.84□□□□□ -1.47
SSM4P40318 CRZ1YNL027W 2037 nt5.84□□□□□ -1.47
SSM4P40318 STE12YHR084W 2067 nt5.84□□□□□ -1.48
SSM4P40318 HXT5YHR096C 1779 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 PCL10YGL134W 1302 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 MAD3YJL013C 1548 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 KEX1YGL203C 2190 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YNL095CYNL095C 1929 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 ELO2YCR034W 1044 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 SPC19YDR201W 498 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 SPO74YGL170C 1242 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 EOS1YNL080C 1101 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 EXO1YOR033C 2109 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YPL025CYPL025C 558 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 HSP82YPL240C 2130 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 CDC15YAR019C 2925 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 AAP1YHR047C 2571 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 NTA1YJR062C 1374 nt5.83□□□□□ -1.48
SSM4P40318 RNR3YIL066C 2610 nt5.82□□□□□ -1.48
SSM4P40318 ARP10YDR106W 855 nt5.82□□□□□ -1.48
SSM4P40318 NCE103YNL036W 666 nt5.82□□□□□ -1.48
SSM4P40318 IML2YJL082W 2196 nt5.82□□□□□ -1.48
SSM4P40318 ATH1YPR026W 3636 nt5.82□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YTA6YPL074W 2265 nt5.81□□□□□ -1.48
SSM4P40318 RPS16BYDL083C 432 nt5.81□□□□□ -1.48
SSM4P40318 RSM10YDR041W 612 nt5.81□□□□□ -1.48
SSM4P40318 UBC6YER100W 753 nt5.81□□□□□ -1.48
SSM4P40318 SOL4YGR248W 768 nt5.81□□□□□ -1.48
SSM4P40318 GDT1YBR187W 843 nt5.81□□□□□ -1.48
SSM4P40318 DHH1YDL160C 1521 nt5.81□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YGL118CYGL118C 438 nt5.8□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YGR011WYGR011W 327 nt5.8□□□□□ -1.48
SSM4P40318 LSB1YGR136W 726 nt5.8□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YET2YMR040W 483 nt5.8□□□□□ -1.48
SSM4P40318 RPL19AYBR084C-A 570 nt5.8□□□□□ -1.48
SSM4P40318 TEL2YGR099W 2067 nt5.8□□□□□ -1.48
SSM4P40318 MPP10YJR002W 1782 nt5.8□□□□□ -1.48
SSM4P40318 BRE4YDL231C 3378 nt5.8□□□□□ -1.48
SSM4P40318 DXO1YDR370C 1329 nt5.8□□□□□ -1.48
SSM4P40318 XKS1YGR194C 1803 nt5.79□□□□□ -1.48
SSM4P40318 GIP1YBR045C 1920 nt5.79□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YFT2YDR319C 825 nt5.79□□□□□ -1.48
SSM4P40318 RPL14AYKL006W 417 nt5.79□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YBL029WYBL029W 1131 nt5.79□□□□□ -1.48
SSM4P40318 ADP1YCR011C 3150 nt5.79□□□□□ -1.48
SSM4P40318 FAT3YKL187C 2253 nt5.79□□□□□ -1.48
SSM4P40318 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.79□□□□□ -1.48
SSM4P40318 CWH43YCR017C 2862 nt5.79□□□□□ -1.48
SSM4P40318 CTS2YDR371W 1536 nt5.78□□□□□ -1.48
SSM4P40318 TAH18YPR048W 1872 nt5.78□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YMR130WYMR130W 909 nt5.78□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YBL081WYBL081W 1107 nt5.78□□□□□ -1.48
SSM4P40318 RIA1YNL163C 3333 nt5.78□□□□□ -1.48
SSM4P40318 YER134CYER134C 537 nt5.77□□□□□ -1.49
SSM4P40318 TAF4YMR005W 1167 nt5.77□□□□□ -1.49
SSM4P40318 AIM41YOR215C 558 nt5.77□□□□□ -1.49
SSM4P40318 CWC27YPL064C 906 nt5.77□□□□□ -1.49
SSM4P40318 ARR1YPR199C 885 nt5.77□□□□□ -1.49
SSM4P40318 NOC4YPR144C 1659 nt5.77□□□□□ -1.49
SSM4P40318 MET17YLR303W 1335 nt5.77□□□□□ -1.49
SSM4P40318 TPA1YER049W 1935 nt5.77□□□□□ -1.49
SSM4P40318 TRF5YNL299W 1929 nt5.77□□□□□ -1.49
SSM4P40318 GSH2YOL049W 1476 nt5.76□□□□□ -1.49
SSM4P40318 MAD2YJL030W 591 nt5.76□□□□□ -1.49
SSM4P40318 GCR2YNL199C 1605 nt5.76□□□□□ -1.49
SSM4P40318 MMT1YMR177W 1533 nt5.76□□□□□ -1.49
SSM4P40318 PAN1YIR006C 4443 nt5.76□□□□□ -1.49
SSM4P40318 HER2YMR293C 1395 nt5.76□□□□□ -1.49
SSM4P40318 MRPL20YKR085C 588 nt5.75□□□□□ -1.49
SSM4P40318 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.75□□□□□ -1.49
SSM4P40318 RPL18BYNL301C 561 nt5.75□□□□□ -1.49
SSM4P40318 YOR289WYOR289W 756 nt5.75□□□□□ -1.49
SSM4P40318 EFM2YBR271W 1260 nt5.75□□□□□ -1.49
SSM4P40318 KIN4YOR233W 2403 nt5.75□□□□□ -1.49
SSM4P40318 HOF1YMR032W 2010 nt5.75□□□□□ -1.49
SSM4P40318 RAI1YGL246C 1164 nt5.74□□□□□ -1.49
SSM4P40318 YNR068CYNR068C 819 nt5.74□□□□□ -1.49
SSM4P40318 SSH1YBR283C 1473 nt5.74□□□□□ -1.49
SSM4P40318 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt5.74□□□□□ -1.49
SSM4P40318 UTP11YKL099C 753 nt5.74□□□□□ -1.49
SSM4P40318 YNR061CYNR061C 660 nt5.74□□□□□ -1.49
SSM4P40318 IXR1YKL032C 1794 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 MDR1YGR100W 2853 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 INO2YDR123C 915 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 CNN1YFR046C 1086 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 AIM21YIR003W 2040 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 YLL017WYLL017W 312 nt5.73□□□□□ -1.49
SSM4P40318 ADE6YGR061C 4077 nt5.72□□□□□ -1.49
SSM4P40318 SMP1YBR182C 1359 nt5.72□□□□□ -1.49
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