Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH5P33151 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH5P33151 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH5P33151 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH5P33151 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH5P33151 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH5P33151 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH5P33151 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH5P33151 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH5P33151 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH5P33151 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH5P33151 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH5P33151 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH5P33151 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH5P33151 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH5P33151 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH5P33151 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH5P33151 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH5P33151 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH5P33151 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH5P33151 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH5P33151 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH5P33151 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH5P33151 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH5P33151 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH5P33151 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH5P33151 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH5P33151 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH5P33151 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH5P33151 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH5P33151 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH5P33151 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH5P33151 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH5P33151 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH5P33151 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH5P33151 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH5P33151 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH5P33151 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH5P33151 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH5P33151 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH5P33151 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH5P33151 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH5P33151 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH5P33151 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH5P33151 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH5P33151 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH5P33151 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH5P33151 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH5P33151 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH5P33151 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH5P33151 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH5P33151 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH5P33151 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH5P33151 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms