Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VDAC1P21796 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VDAC1P21796 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms