Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM49P0CI25 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM49P0CI25 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49P0CI25 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49P0CI25 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49P0CI25 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM49P0CI25 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms