Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFLP07196 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFLP07196 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEFLP07196 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFLP07196 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFLP07196 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFLP07196 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFLP07196 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFLP07196 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFLP07196 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFLP07196 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEFLP07196 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFLP07196 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFLP07196 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFLP07196 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFLP07196 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFLP07196 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFLP07196 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFLP07196 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFLP07196 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEFLP07196 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEFLP07196 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEFLP07196 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEFLP07196 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEFLP07196 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFLP07196 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFLP07196 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFLP07196 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFLP07196 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFLP07196 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFLP07196 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFLP07196 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEFLP07196 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NEFLP07196 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NEFLP07196 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFLP07196 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFLP07196 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFLP07196 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFLP07196 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFLP07196 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFLP07196 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEFLP07196 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEFLP07196 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEFLP07196 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFLP07196 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFLP07196 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFLP07196 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFLP07196 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEFLP07196 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFLP07196 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFLP07196 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFLP07196 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFLP07196 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEFLP07196 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEFLP07196 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFLP07196 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFLP07196 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFLP07196 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFLP07196 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFLP07196 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFLP07196 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFLP07196 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NEFLP07196 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFLP07196 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFLP07196 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFLP07196 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFLP07196 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NEFLP07196 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEFLP07196 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEFLP07196 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms