Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLIN3O60664 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLIN3O60664 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLIN3O60664 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLIN3O60664 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLIN3O60664 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLIN3O60664 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms