Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT87PA6NCN2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT87PA6NCN2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms