Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC78A2IDD5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC78A2IDD5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms