Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 411.46□□□□□ -0.571e-25■■■■■ 104.8
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AATFQ9NY61 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 210.5□□□□□ -0.731e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 49.05□□□□□ -0.961e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 28.57□□□□□ -1.041e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 48.49□□□□□ -1.051e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.431e-25■■■■■ 104.8
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AATFQ9NY61 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.263e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.173e-10■■■■■ 104.3
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AATFQ9NY61 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.833e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 518.83■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.533e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 517.77■□□□□ 0.433e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.383e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-204ENST00000593535 549 ntTSL 415.98■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 104.3
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AATFQ9NY61 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 211.64□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 98.4
AATFQ9NY61 EHMT1-206ENST00000465566 503 ntTSL 39.51□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 98.4
AATFQ9NY61 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 213.1□□□□□ -0.311e-13■■■■■ 97
AATFQ9NY61 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 416.48■□□□□ 0.239e-22■■■■■ 96.8
AATFQ9NY61 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.049e-22■■■■■ 96.8
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AATFQ9NY61 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.819e-22■■■■■ 96.8
AATFQ9NY61 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 25.46□□□□□ -1.549e-22■■■■■ 96.8
AATFQ9NY61 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 95.5
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AATFQ9NY61 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.265e-11■■■■■ 91.9
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AATFQ9NY61 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 224.13■■□□□ 1.459e-10■■■■■ 91.2
AATFQ9NY61 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)17.42■□□□□ 0.389e-10■■■■■ 91.2
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AATFQ9NY61 COX7C-204ENST00000510447 581 ntTSL 313.13□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 90.6
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AATFQ9NY61 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 90.6
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AATFQ9NY61 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 33.35□□□□□ -1.872e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 22.69□□□□□ -1.982e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.72e-8■■■■■ 90.6
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AATFQ9NY61 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-10■■■■■ 89.9
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AATFQ9NY61 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 213.48□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 89.4
AATFQ9NY61 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 89.2
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AATFQ9NY61 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.844e-10■■■■■ 87.1
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AATFQ9NY61 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 317.94■□□□□ 0.462e-12■■■■■ 86
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AATFQ9NY61 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 415.11■□□□□ 0.012e-12■■■■■ 86
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AATFQ9NY61 TMEM14B-217ENST00000489137 374 ntTSL 35.34□□□□□ -1.552e-12■■■■■ 86
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AATFQ9NY61 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 217.74■□□□□ 0.431e-323■■■■■ 85.5
AATFQ9NY61 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 313.83□□□□□ -0.21e-323■■■■■ 85.5
AATFQ9NY61 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 513.76□□□□□ -0.211e-323■■■■■ 85.5
AATFQ9NY61 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 44.41□□□□□ -1.71e-323■■■■■ 85.5
AATFQ9NY61 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 216.12■□□□□ 0.174e-9■■■■■ 85.4
AATFQ9NY61 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.414e-9■■■■■ 85.4
AATFQ9NY61 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.454e-9■■■■■ 85.4
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