Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AATFQ9NY61 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt13.19□□□□□ -0.31e-323■■■■■ 2362.2
AATFQ9NY61 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 599.2
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AATFQ9NY61 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 252.8
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AATFQ9NY61 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 143.7
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AATFQ9NY61 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 142.9
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AATFQ9NY61 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 142.9
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AATFQ9NY61 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-212ENST00000462201 1122 ntTSL 310.4□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-216ENST00000492782 711 ntTSL 27.84□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 142.9
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AATFQ9NY61 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)29.05■■■□□ 2.243e-16■■■■■ 142.7
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