Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AATFQ9NY61 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt13.19□□□□□ -0.31e-323■■■■■ 2362.2
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AATFQ9NY61 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 252.8
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AATFQ9NY61 TF-214ENST00000498622 719 ntTSL 210.08□□□□□ -0.81e-16■■■■■ 155.1
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AATFQ9NY61 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 143.7
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AATFQ9NY61 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.422e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-213ENST00000471793 1779 ntTSL 222.49■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 142.9
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AATFQ9NY61 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 142.9
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AATFQ9NY61 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 142.9
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AATFQ9NY61 IKZF1-212ENST00000462201 1122 ntTSL 310.4□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 142.9
AATFQ9NY61 IKZF1-216ENST00000492782 711 ntTSL 27.84□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 142.9
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AATFQ9NY61 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)29.05■■■□□ 2.243e-16■■■■■ 142.7
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