Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 HEM12YDR047W 1089 nt10.86□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 AHT1YHR093W 549 nt10.85□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 MRPL8YJL063C 717 nt10.85□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 DDR2YOL052C-A 186 nt10.85□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.84□□□□□ -0.67
UBX3Q12229 SPC25YER018C 666 nt10.82□□□□□ -0.68
UBX3Q12229 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.82□□□□□ -0.68
UBX3Q12229 ANP1YEL036C 1503 nt10.81□□□□□ -0.68
UBX3Q12229 STB1YNL309W 1263 nt10.81□□□□□ -0.68
UBX3Q12229 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.79□□□□□ -0.68
UBX3Q12229 YPR064WYPR064W 420 nt10.78□□□□□ -0.68
UBX3Q12229 SWE1YJL187C 2460 nt10.77□□□□□ -0.69
UBX3Q12229 ADO1YJR105W 1023 nt10.75□□□□□ -0.69
UBX3Q12229 HUA1YGR268C 597 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX3Q12229 TAD3YLR316C 969 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX3Q12229 GPI16YHR188C 1833 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX3Q12229 FEN2YCR028C 1539 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX3Q12229 CCT4YDL143W 1587 nt10.73□□□□□ -0.69
UBX3Q12229 VPS60YDR486C 690 nt10.71□□□□□ -0.69
UBX3Q12229 RAX1YOR301W 1308 nt10.7□□□□□ -0.7
UBX3Q12229 ALG3YBL082C 1377 nt10.68□□□□□ -0.7
UBX3Q12229 YJL225CYJL225C 5277 nt10.66□□□□□ -0.7
UBX3Q12229 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.65□□□□□ -0.7
UBX3Q12229 YIR016WYIR016W 798 nt10.64□□□□□ -0.71
UBX3Q12229 MIC12YBR262C 321 nt10.64□□□□□ -0.71
UBX3Q12229 BDH1YAL060W 1149 nt10.63□□□□□ -0.71
UBX3Q12229 CCA1YER168C 1641 nt10.62□□□□□ -0.71
UBX3Q12229 SWC5YBR231C 912 nt10.62□□□□□ -0.71
UBX3Q12229 BNA2YJR078W 1362 nt10.6□□□□□ -0.71
UBX3Q12229 YSP3YOR003W 1437 nt10.54□□□□□ -0.72
UBX3Q12229 YLR415CYLR415C 339 nt10.53□□□□□ -0.72
UBX3Q12229 AGP1YCL025C 1902 nt10.52□□□□□ -0.72
UBX3Q12229 HHO1YPL127C 777 nt10.51□□□□□ -0.73
UBX3Q12229 YGR201CYGR201C 678 nt10.46□□□□□ -0.73
UBX3Q12229 XDJ1YLR090W 1380 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX3Q12229 NVJ2YPR091C 2313 nt10.45□□□□□ -0.74
UBX3Q12229 YFR018CYFR018C 1092 nt10.43□□□□□ -0.74
UBX3Q12229 PEX25YPL112C 1185 nt10.43□□□□□ -0.74
UBX3Q12229 YNL115CYNL115C 1935 nt10.43□□□□□ -0.74
UBX3Q12229 FUR4YBR021W 1902 nt10.43□□□□□ -0.74
UBX3Q12229 YFL066CYFL066C 1179 nt10.41□□□□□ -0.74
UBX3Q12229 YDR094WYDR094W 336 nt10.4□□□□□ -0.74
UBX3Q12229 SHM2YLR058C 1410 nt10.4□□□□□ -0.75
UBX3Q12229 DUT1YBR252W 444 nt10.39□□□□□ -0.75
UBX3Q12229 GDH3YAL062W 1374 nt10.39□□□□□ -0.75
UBX3Q12229 HSP60YLR259C 1719 nt10.38□□□□□ -0.75
UBX3Q12229 PRE6YOL038W 765 nt10.37□□□□□ -0.75
UBX3Q12229 TIM17YJL143W 477 nt10.35□□□□□ -0.75
UBX3Q12229 BOR1YNL275W 1731 nt10.34□□□□□ -0.75
UBX3Q12229 UBX6YJL048C 1191 nt10.34□□□□□ -0.75
UBX3Q12229 AVT6YER119C 1347 nt10.33□□□□□ -0.76
UBX3Q12229 GLK1YCL040W 1503 nt10.33□□□□□ -0.76
UBX3Q12229 NIT1YIL164C 600 nt10.33□□□□□ -0.76
UBX3Q12229 DUS1YML080W 1272 nt10.31□□□□□ -0.76
UBX3Q12229 YCL074WYCL074W 927 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX3Q12229 VPS75YNL246W 795 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX3Q12229 GOR1YNL274C 1053 nt10.29□□□□□ -0.76
UBX3Q12229 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
UBX3Q12229 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
UBX3Q12229 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
UBX3Q12229 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.27□□□□□ -0.77
UBX3Q12229 STR3YGL184C 1398 nt10.26□□□□□ -0.77
UBX3Q12229 SGT2YOR007C 1041 nt10.25□□□□□ -0.77
UBX3Q12229 DAT1YML113W 747 nt10.24□□□□□ -0.77
UBX3Q12229 PAU16YKL224C 372 nt10.22□□□□□ -0.77
UBX3Q12229 RRT5YFR032C 870 nt10.21□□□□□ -0.77
UBX3Q12229 PRP4YPR178W 1398 nt10.2□□□□□ -0.78
UBX3Q12229 YKR005CYKR005C 1578 nt10.19□□□□□ -0.78
UBX3Q12229 AQY2YLL052C 450 nt10.16□□□□□ -0.78
UBX3Q12229 DPS1YLL018C 1674 nt10.15□□□□□ -0.78
UBX3Q12229 YCR102CYCR102C 1107 nt10.14□□□□□ -0.79
UBX3Q12229 NBP35YGL091C 987 nt10.13□□□□□ -0.79
UBX3Q12229 MIR1YJR077C 936 nt10.13□□□□□ -0.79
UBX3Q12229 YGR259CYGR259C 441 nt10.12□□□□□ -0.79
UBX3Q12229 YDR010CYDR010C 333 nt10.09□□□□□ -0.79
UBX3Q12229 PAU7YAR020C 168 nt10.08□□□□□ -0.8
UBX3Q12229 SHB17YKR043C 816 nt10.06□□□□□ -0.8
UBX3Q12229 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.05□□□□□ -0.8
UBX3Q12229 BMT6YLR063W 1098 nt10.05□□□□□ -0.8
UBX3Q12229 RTN2YDL204W 1182 nt10.04□□□□□ -0.8
UBX3Q12229 AAC1YMR056C 930 nt10.04□□□□□ -0.8
UBX3Q12229 SNF1YDR477W 1902 nt10.03□□□□□ -0.8
UBX3Q12229 THI74YDR438W 1113 nt10.02□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 ALG12YNR030W 1656 nt10.02□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 SHH4YLR164W 507 nt10.01□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 UBA4YHR111W 1323 nt10□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 ARP6YLR085C 1317 nt10□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 IRC24YIR036C 792 nt9.99□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 TIR3YIL011W 810 nt9.98□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 RET2YFR051C 1641 nt9.97□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 RPM1RPM1 483 nt9.97□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 PLB1YMR008C 1995 nt9.97□□□□□ -0.81
UBX3Q12229 SFA1YDL168W 1161 nt9.96□□□□□ -0.82
UBX3Q12229 NAT4YMR069W 858 nt9.96□□□□□ -0.82
UBX3Q12229 MSF1YPR047W 1410 nt9.96□□□□□ -0.82
UBX3Q12229 BIO5YNR056C 1686 nt9.93□□□□□ -0.82
UBX3Q12229 LSC2YGR244C 1284 nt9.92□□□□□ -0.82
UBX3Q12229 POM34YLR018C 900 nt9.91□□□□□ -0.82
UBX3Q12229 PHO89YBR296C 1725 nt9.9□□□□□ -0.82
UBX3Q12229 YSR3YKR053C 1215 nt9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.3 ms