Protein–RNA interactions for Protein: P40454

RRD1, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRD1P40454 PTP1YDL230W 1008 nt12.5□□□□□ -0.41
RRD1P40454 YSR3YKR053C 1215 nt12.5□□□□□ -0.41
RRD1P40454 PET9YBL030C 957 nt12.5□□□□□ -0.41
RRD1P40454 YDR095CYDR095C 411 nt12.48□□□□□ -0.41
RRD1P40454 YLR111WYLR111W 333 nt12.48□□□□□ -0.41
RRD1P40454 XYL2YLR070C 1071 nt12.46□□□□□ -0.41
RRD1P40454 ARO7YPR060C 771 nt12.45□□□□□ -0.42
RRD1P40454 FMP52YER004W 696 nt12.44□□□□□ -0.42
RRD1P40454 TIM44YIL022W 1296 nt12.44□□□□□ -0.42
RRD1P40454 CWP1YKL096W 720 nt12.44□□□□□ -0.42
RRD1P40454 RIB1YBL033C 1038 nt12.44□□□□□ -0.42
RRD1P40454 ALG3YBL082C 1377 nt12.42□□□□□ -0.42
RRD1P40454 PAU7YAR020C 168 nt12.4□□□□□ -0.42
RRD1P40454 ART5YGR068C 1761 nt12.39□□□□□ -0.43
RRD1P40454 YJL195CYJL195C 702 nt12.39□□□□□ -0.43
RRD1P40454 CPD1YGR247W 720 nt12.37□□□□□ -0.43
RRD1P40454 GPN2YOR262W 1044 nt12.36□□□□□ -0.43
RRD1P40454 ADH2YMR303C 1047 nt12.35□□□□□ -0.43
RRD1P40454 AIM45YPR004C 1035 nt12.35□□□□□ -0.43
RRD1P40454 YCR087WYCR087W 516 nt12.34□□□□□ -0.43
RRD1P40454 ERG6YML008C 1152 nt12.33□□□□□ -0.44
RRD1P40454 SHB17YKR043C 816 nt12.31□□□□□ -0.44
RRD1P40454 QDR2YIL121W 1629 nt12.29□□□□□ -0.44
RRD1P40454 FPS1YLL043W 2010 nt12.29□□□□□ -0.44
RRD1P40454 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.23□□□□□ -0.45
RRD1P40454 RPP2AYOL039W 321 nt12.23□□□□□ -0.45
RRD1P40454 GFD2YCL036W 1701 nt12.23□□□□□ -0.45
RRD1P40454 AQY1YPR192W 918 nt12.22□□□□□ -0.45
RRD1P40454 YEL008WYEL008W 381 nt12.2□□□□□ -0.46
RRD1P40454 PAM17YKR065C 594 nt12.2□□□□□ -0.46
RRD1P40454 YSC84YHR016C 1407 nt12.16□□□□□ -0.46
RRD1P40454 IRC15YPL017C 1500 nt12.16□□□□□ -0.46
RRD1P40454 YIH1YCR059C 777 nt12.15□□□□□ -0.46
RRD1P40454 SOD2YHR008C 702 nt12.15□□□□□ -0.46
RRD1P40454 SLG1YOR008C 1137 nt12.14□□□□□ -0.47
RRD1P40454 YDR010CYDR010C 333 nt12.13□□□□□ -0.47
RRD1P40454 YJL064WYJL064W 396 nt12.13□□□□□ -0.47
RRD1P40454 RAD23YEL037C 1197 nt12.12□□□□□ -0.47
RRD1P40454 YIA6YIL006W 1122 nt12.12□□□□□ -0.47
RRD1P40454 PAU19YMR325W 375 nt12.12□□□□□ -0.47
RRD1P40454 TOS1YBR162C 1368 nt12.12□□□□□ -0.47
RRD1P40454 SPT8YLR055C 1809 nt12.11□□□□□ -0.47
RRD1P40454 POP2YNR052C 1302 nt12.11□□□□□ -0.47
RRD1P40454 AAC1YMR056C 930 nt12.1□□□□□ -0.47
RRD1P40454 YBR232CYBR232C 360 nt12.1□□□□□ -0.47
RRD1P40454 RET2YFR051C 1641 nt12.09□□□□□ -0.47
RRD1P40454 REG2YBR050C 1017 nt12.09□□□□□ -0.47
RRD1P40454 PHO89YBR296C 1725 nt12.08□□□□□ -0.47
RRD1P40454 ADH1YOL086C 1047 nt12.07□□□□□ -0.48
RRD1P40454 CCT4YDL143W 1587 nt12.06□□□□□ -0.48
RRD1P40454 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.05□□□□□ -0.48
RRD1P40454 PGC1YPL206C 966 nt12.01□□□□□ -0.49
RRD1P40454 YER152W-AYER152W-A 567 nt12□□□□□ -0.49
RRD1P40454 SPC25YER018C 666 nt11.99□□□□□ -0.49
RRD1P40454 PCM1YEL058W 1674 nt11.98□□□□□ -0.49
RRD1P40454 MRP20YDR405W 792 nt11.96□□□□□ -0.49
RRD1P40454 VAR1Q0140 1197 nt11.96□□□□□ -0.49
RRD1P40454 CAB5YDR196C 726 nt11.95□□□□□ -0.5
RRD1P40454 RIB3YDR487C 627 nt11.95□□□□□ -0.5
RRD1P40454 STB1YNL309W 1263 nt11.95□□□□□ -0.5
RRD1P40454 SWC5YBR231C 912 nt11.95□□□□□ -0.5
RRD1P40454 YLL053CYLL053C 459 nt11.93□□□□□ -0.5
RRD1P40454 SDH5YOL071W 489 nt11.93□□□□□ -0.5
RRD1P40454 FTR1YER145C 1215 nt11.92□□□□□ -0.5
RRD1P40454 GPI16YHR188C 1833 nt11.89□□□□□ -0.51
RRD1P40454 BUD20YLR074C 501 nt11.88□□□□□ -0.51
RRD1P40454 STP3YLR375W 1032 nt11.88□□□□□ -0.51
RRD1P40454 TIM17YJL143W 477 nt11.87□□□□□ -0.51
RRD1P40454 COQ2YNR041C 1119 nt11.86□□□□□ -0.51
RRD1P40454 VPS60YDR486C 690 nt11.85□□□□□ -0.51
RRD1P40454 PAU5YFL020C 369 nt11.83□□□□□ -0.52
RRD1P40454 RTS2YOR077W 699 nt11.83□□□□□ -0.52
RRD1P40454 SPT5YML010W 3192 nt11.82□□□□□ -0.52
RRD1P40454 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.82□□□□□ -0.52
RRD1P40454 YPI1YFR003C 468 nt11.82□□□□□ -0.52
RRD1P40454 BUR6YER159C 429 nt11.81□□□□□ -0.52
RRD1P40454 CUE1YMR264W 612 nt11.8□□□□□ -0.52
RRD1P40454 MFG1YDL233W 1377 nt11.78□□□□□ -0.52
RRD1P40454 RPL4BYDR012W 1089 nt11.77□□□□□ -0.53
RRD1P40454 RPL4AYBR031W 1089 nt11.77□□□□□ -0.53
RRD1P40454 TRM5YHR070W 1500 nt11.76□□□□□ -0.53
RRD1P40454 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.73□□□□□ -0.53
RRD1P40454 TIP1YBR067C 633 nt11.72□□□□□ -0.53
RRD1P40454 RPS14BYJL191W 417 nt11.71□□□□□ -0.53
RRD1P40454 Q0010Q0010 387 nt11.7□□□□□ -0.54
RRD1P40454 BMT5YIL096C 1011 nt11.69□□□□□ -0.54
RRD1P40454 YGR012WYGR012W 1182 nt11.68□□□□□ -0.54
RRD1P40454 TSC10YBR265W 963 nt11.65□□□□□ -0.54
RRD1P40454 YDR509WYDR509W 348 nt11.64□□□□□ -0.55
RRD1P40454 CLB6YGR109C 1143 nt11.64□□□□□ -0.55
RRD1P40454 HOG1YLR113W 1308 nt11.63□□□□□ -0.55
RRD1P40454 RPL12BYDR418W 498 nt11.63□□□□□ -0.55
RRD1P40454 SGT2YOR007C 1041 nt11.63□□□□□ -0.55
RRD1P40454 YIL100WYIL100W 354 nt11.62□□□□□ -0.55
RRD1P40454 YOR268CYOR268C 399 nt11.62□□□□□ -0.55
RRD1P40454 SHM2YLR058C 1410 nt11.61□□□□□ -0.55
RRD1P40454 ARA2YMR041C 1008 nt11.6□□□□□ -0.55
RRD1P40454 FEN2YCR028C 1539 nt11.59□□□□□ -0.55
RRD1P40454 DDR2YOL052C-A 186 nt11.57□□□□□ -0.56
RRD1P40454 NIT1YIL164C 600 nt11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms