Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 UBA4YHR111W 1323 nt13.7□□□□□ -0.22
UBP1P25037 SSA4YER103W 1929 nt13.69□□□□□ -0.22
UBP1P25037 FTR1YER145C 1215 nt13.69□□□□□ -0.22
UBP1P25037 YLL053CYLL053C 459 nt13.68□□□□□ -0.22
UBP1P25037 EMI2YDR516C 1503 nt13.68□□□□□ -0.22
UBP1P25037 CCT4YDL143W 1587 nt13.67□□□□□ -0.22
UBP1P25037 YDL221WYDL221W 552 nt13.67□□□□□ -0.22
UBP1P25037 RBG1YAL036C 1110 nt13.67□□□□□ -0.22
UBP1P25037 GIS3YLR094C 1509 nt13.67□□□□□ -0.22
UBP1P25037 YSR3YKR053C 1215 nt13.65□□□□□ -0.22
UBP1P25037 GAL1YBR020W 1587 nt13.63□□□□□ -0.23
UBP1P25037 SPC25YER018C 666 nt13.63□□□□□ -0.23
UBP1P25037 RAD51YER095W 1203 nt13.63□□□□□ -0.23
UBP1P25037 STB1YNL309W 1263 nt13.63□□□□□ -0.23
UBP1P25037 SWC5YBR231C 912 nt13.62□□□□□ -0.23
UBP1P25037 GPI16YHR188C 1833 nt13.6□□□□□ -0.23
UBP1P25037 YMR090WYMR090W 684 nt13.6□□□□□ -0.23
UBP1P25037 SPT8YLR055C 1809 nt13.57□□□□□ -0.24
UBP1P25037 XYL2YLR070C 1071 nt13.56□□□□□ -0.24
UBP1P25037 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.55□□□□□ -0.24
UBP1P25037 SHB17YKR043C 816 nt13.55□□□□□ -0.24
UBP1P25037 TRM5YHR070W 1500 nt13.54□□□□□ -0.24
UBP1P25037 YCR087WYCR087W 516 nt13.52□□□□□ -0.25
UBP1P25037 ALG3YBL082C 1377 nt13.5□□□□□ -0.25
UBP1P25037 YNR029CYNR029C 1290 nt13.5□□□□□ -0.25
UBP1P25037 VPS60YDR486C 690 nt13.49□□□□□ -0.25
UBP1P25037 BIO4YNR057C 714 nt13.49□□□□□ -0.25
UBP1P25037 YLR111WYLR111W 333 nt13.45□□□□□ -0.26
UBP1P25037 DDR2YOL052C-A 186 nt13.45□□□□□ -0.26
UBP1P25037 AIM45YPR004C 1035 nt13.44□□□□□ -0.26
UBP1P25037 TIM17YJL143W 477 nt13.43□□□□□ -0.26
UBP1P25037 STE4YOR212W 1272 nt13.43□□□□□ -0.26
UBP1P25037 YNL195CYNL195C 786 nt13.4□□□□□ -0.26
UBP1P25037 SCC4YER147C 1875 nt13.38□□□□□ -0.27
UBP1P25037 YFL067WYFL067W 528 nt13.38□□□□□ -0.27
UBP1P25037 SIM1YIL123W 1431 nt13.38□□□□□ -0.27
UBP1P25037 YLR349WYLR349W 507 nt13.35□□□□□ -0.27
UBP1P25037 PHO89YBR296C 1725 nt13.35□□□□□ -0.27
UBP1P25037 YDR010CYDR010C 333 nt13.34□□□□□ -0.27
UBP1P25037 FEN2YCR028C 1539 nt13.34□□□□□ -0.27
UBP1P25037 RET2YFR051C 1641 nt13.33□□□□□ -0.28
UBP1P25037 ADH7YCR105W 1086 nt13.33□□□□□ -0.28
UBP1P25037 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.33□□□□□ -0.28
UBP1P25037 ATF2YGR177C 1608 nt13.29□□□□□ -0.28
UBP1P25037 SDH1YKL148C 1923 nt13.29□□□□□ -0.28
UBP1P25037 PAU15YIR041W 375 nt13.28□□□□□ -0.28
UBP1P25037 ERF2YLR246W 1080 nt13.27□□□□□ -0.29
UBP1P25037 MRP20YDR405W 792 nt13.25□□□□□ -0.29
UBP1P25037 ANP1YEL036C 1503 nt13.23□□□□□ -0.29
UBP1P25037 FUN14YAL008W 597 nt13.19□□□□□ -0.3
UBP1P25037 YIR016WYIR016W 798 nt13.18□□□□□ -0.3
UBP1P25037 SHM2YLR058C 1410 nt13.18□□□□□ -0.3
UBP1P25037 BDF1YLR399C 2061 nt13.16□□□□□ -0.3
UBP1P25037 SGT2YOR007C 1041 nt13.14□□□□□ -0.31
UBP1P25037 CRR1YLR213C 1269 nt13.13□□□□□ -0.31
UBP1P25037 SDH5YOL071W 489 nt13.12□□□□□ -0.31
UBP1P25037 RAD23YEL037C 1197 nt13.11□□□□□ -0.31
UBP1P25037 COQ2YNR041C 1119 nt13.09□□□□□ -0.31
UBP1P25037 YLR279WYLR279W 390 nt13.08□□□□□ -0.32
UBP1P25037 YJL195CYJL195C 702 nt13.07□□□□□ -0.32
UBP1P25037 NIT1YIL164C 600 nt13.05□□□□□ -0.32
UBP1P25037 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt13.05□□□□□ -0.32
UBP1P25037 RRT12YCR045C 1476 nt13.04□□□□□ -0.32
UBP1P25037 XDJ1YLR090W 1380 nt13.04□□□□□ -0.32
UBP1P25037 ESS1YJR017C 513 nt13.03□□□□□ -0.32
UBP1P25037 SNG1YGR197C 1644 nt13.02□□□□□ -0.32
UBP1P25037 YBR220CYBR220C 1683 nt13.02□□□□□ -0.32
UBP1P25037 RPL4BYDR012W 1089 nt13.02□□□□□ -0.33
UBP1P25037 RPL4AYBR031W 1089 nt13.02□□□□□ -0.33
UBP1P25037 HEM12YDR047W 1089 nt13.01□□□□□ -0.33
UBP1P25037 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt13.01□□□□□ -0.33
UBP1P25037 NAP1YKR048C 1254 nt13.01□□□□□ -0.33
UBP1P25037 PAC11YDR488C 1602 nt12.99□□□□□ -0.33
UBP1P25037 YGR139WYGR139W 339 nt12.99□□□□□ -0.33
UBP1P25037 NME1NME1 340 nt12.98□□□□□ -0.33
UBP1P25037 TAT1YBR069C 1860 nt12.97□□□□□ -0.33
UBP1P25037 CLB6YGR109C 1143 nt12.97□□□□□ -0.33
UBP1P25037 GPN2YOR262W 1044 nt12.95□□□□□ -0.34
UBP1P25037 CPD1YGR247W 720 nt12.94□□□□□ -0.34
UBP1P25037 GDH3YAL062W 1374 nt12.93□□□□□ -0.34
UBP1P25037 RIB3YDR487C 627 nt12.92□□□□□ -0.34
UBP1P25037 NVJ2YPR091C 2313 nt12.91□□□□□ -0.34
UBP1P25037 RPS14BYJL191W 417 nt12.9□□□□□ -0.34
UBP1P25037 PUP1YOR157C 786 nt12.89□□□□□ -0.35
UBP1P25037 MIC10YCL057C-A 294 nt12.88□□□□□ -0.35
UBP1P25037 YEL008WYEL008W 381 nt12.87□□□□□ -0.35
UBP1P25037 SEN2YLR105C 1134 nt12.86□□□□□ -0.35
UBP1P25037 TSC10YBR265W 963 nt12.85□□□□□ -0.35
UBP1P25037 SFA1YDL168W 1161 nt12.84□□□□□ -0.35
UBP1P25037 ADH1YOL086C 1047 nt12.84□□□□□ -0.35
UBP1P25037 YGR012WYGR012W 1182 nt12.82□□□□□ -0.36
UBP1P25037 UTH1YKR042W 1098 nt12.82□□□□□ -0.36
UBP1P25037 BNA2YJR078W 1362 nt12.81□□□□□ -0.36
UBP1P25037 YHL050CYHL050C 2094 nt12.81□□□□□ -0.36
UBP1P25037 CAB5YDR196C 726 nt12.8□□□□□ -0.36
UBP1P25037 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.8□□□□□ -0.36
UBP1P25037 YPI1YFR003C 468 nt12.76□□□□□ -0.37
UBP1P25037 YGR201CYGR201C 678 nt12.75□□□□□ -0.37
UBP1P25037 YJR114WYJR114W 393 nt12.74□□□□□ -0.37
UBP1P25037 MIC12YBR262C 321 nt12.73□□□□□ -0.37
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