Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.75■□□□□ 0.11
UBP1P25037 LPX1YOR084W 1164 nt15.75■□□□□ 0.11
UBP1P25037 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.74■□□□□ 0.11
UBP1P25037 ERV46YAL042W 1248 nt15.74■□□□□ 0.11
UBP1P25037 HUA1YGR268C 597 nt15.67■□□□□ 0.1
UBP1P25037 NAB2YGL122C 1578 nt15.6■□□□□ 0.09
UBP1P25037 FUN26YAL022C 1554 nt15.58■□□□□ 0.09
UBP1P25037 DAL1YIR027C 1383 nt15.58■□□□□ 0.08
UBP1P25037 FPR4YLR449W 1179 nt15.56■□□□□ 0.08
UBP1P25037 IDH1YNL037C 1083 nt15.56■□□□□ 0.08
UBP1P25037 CCT6YDR188W 1641 nt15.53■□□□□ 0.08
UBP1P25037 YKR040CYKR040C 504 nt15.52■□□□□ 0.08
UBP1P25037 POA1YBR022W 534 nt15.51■□□□□ 0.07
UBP1P25037 YDR433WYDR433W 441 nt15.5■□□□□ 0.07
UBP1P25037 YJL152WYJL152W 360 nt15.49■□□□□ 0.07
UBP1P25037 BUD23YCR047C 828 nt15.48■□□□□ 0.07
UBP1P25037 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.41■□□□□ 0.06
UBP1P25037 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.41■□□□□ 0.06
UBP1P25037 FIS1YIL065C 468 nt15.41■□□□□ 0.06
UBP1P25037 PHO4YFR034C 939 nt15.4■□□□□ 0.06
UBP1P25037 SBA1YKL117W 651 nt15.36■□□□□ 0.05
UBP1P25037 ALF1YNL148C 765 nt15.25■□□□□ 0.03
UBP1P25037 GBP2YCL011C 1284 nt15.25■□□□□ 0.03
UBP1P25037 MXR2YCL033C 507 nt15.2■□□□□ 0.02
UBP1P25037 PAU16YKL224C 372 nt15.04■□□□□ -0
UBP1P25037 YPS1YLR120C 1710 nt15□□□□□ -0.01
UBP1P25037 YKL030WYKL030W 606 nt14.99□□□□□ -0.01
UBP1P25037 TCD2YKL027W 1344 nt14.97□□□□□ -0.01
UBP1P25037 RRT5YFR032C 870 nt14.95□□□□□ -0.02
UBP1P25037 TIR4YOR009W 1464 nt14.94□□□□□ -0.02
UBP1P25037 YLR235CYLR235C 399 nt14.93□□□□□ -0.02
UBP1P25037 Q0182Q0182 405 nt14.89□□□□□ -0.03
UBP1P25037 PTH1YHR189W 573 nt14.89□□□□□ -0.03
UBP1P25037 YFR018CYFR018C 1092 nt14.88□□□□□ -0.03
UBP1P25037 FRD1YEL047C 1413 nt14.88□□□□□ -0.03
UBP1P25037 CAC2YML102W 1407 nt14.87□□□□□ -0.03
UBP1P25037 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.87□□□□□ -0.03
UBP1P25037 YDR095CYDR095C 411 nt14.84□□□□□ -0.03
UBP1P25037 LCB1YMR296C 1677 nt14.77□□□□□ -0.04
UBP1P25037 YCL042WYCL042W 360 nt14.73□□□□□ -0.05
UBP1P25037 SNF6YHL025W 999 nt14.72□□□□□ -0.05
UBP1P25037 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.71□□□□□ -0.05
UBP1P25037 PRE6YOL038W 765 nt14.68□□□□□ -0.06
UBP1P25037 YMR057CYMR057C 372 nt14.67□□□□□ -0.06
UBP1P25037 DED1YOR204W 1815 nt14.64□□□□□ -0.07
UBP1P25037 PET9YBL030C 957 nt14.62□□□□□ -0.07
UBP1P25037 SOR2YDL246C 1074 nt14.6□□□□□ -0.07
UBP1P25037 SOR1YJR159W 1074 nt14.6□□□□□ -0.07
UBP1P25037 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.59□□□□□ -0.07
UBP1P25037 RPP2AYOL039W 321 nt14.57□□□□□ -0.08
UBP1P25037 ART5YGR068C 1761 nt14.56□□□□□ -0.08
UBP1P25037 RRD1YIL153W 1182 nt14.56□□□□□ -0.08
UBP1P25037 NAT4YMR069W 858 nt14.56□□□□□ -0.08
UBP1P25037 DIC1YLR348C 897 nt14.52□□□□□ -0.09
UBP1P25037 TIM23YNR017W 669 nt14.47□□□□□ -0.09
UBP1P25037 FMT1YBL013W 1206 nt14.42□□□□□ -0.1
UBP1P25037 GFD2YCL036W 1701 nt14.41□□□□□ -0.1
UBP1P25037 YMR244WYMR244W 1068 nt14.39□□□□□ -0.11
UBP1P25037 YPR064WYPR064W 420 nt14.39□□□□□ -0.11
UBP1P25037 GLK1YCL040W 1503 nt14.38□□□□□ -0.11
UBP1P25037 PTP1YDL230W 1008 nt14.32□□□□□ -0.12
UBP1P25037 YLR179CYLR179C 606 nt14.32□□□□□ -0.12
UBP1P25037 TAD3YLR316C 969 nt14.31□□□□□ -0.12
UBP1P25037 FMP52YER004W 696 nt14.3□□□□□ -0.12
UBP1P25037 FPS1YLL043W 2010 nt14.3□□□□□ -0.12
UBP1P25037 MSF1YPR047W 1410 nt14.3□□□□□ -0.12
UBP1P25037 PEX25YPL112C 1185 nt14.29□□□□□ -0.12
UBP1P25037 YFL066CYFL066C 1179 nt14.28□□□□□ -0.12
UBP1P25037 CWP1YKL096W 720 nt14.26□□□□□ -0.13
UBP1P25037 GLR1YPL091W 1452 nt14.19□□□□□ -0.14
UBP1P25037 THI74YDR438W 1113 nt14.16□□□□□ -0.14
UBP1P25037 RBG2YGR173W 1107 nt14.14□□□□□ -0.15
UBP1P25037 ADH2YMR303C 1047 nt14.14□□□□□ -0.15
UBP1P25037 AHT1YHR093W 549 nt14.13□□□□□ -0.15
UBP1P25037 WSC2YNL283C 1512 nt14.12□□□□□ -0.15
UBP1P25037 RTS2YOR077W 699 nt14.1□□□□□ -0.15
UBP1P25037 MIR1YJR077C 936 nt14.07□□□□□ -0.16
UBP1P25037 YNL115CYNL115C 1935 nt14.06□□□□□ -0.16
UBP1P25037 YSP3YOR003W 1437 nt14.03□□□□□ -0.16
UBP1P25037 CUE1YMR264W 612 nt14.02□□□□□ -0.17
UBP1P25037 RNQ1YCL028W 1218 nt14□□□□□ -0.17
UBP1P25037 MEP2YNL142W 1500 nt13.98□□□□□ -0.17
UBP1P25037 YLR415CYLR415C 339 nt13.97□□□□□ -0.17
UBP1P25037 BDH1YAL060W 1149 nt13.96□□□□□ -0.17
UBP1P25037 YIH1YCR059C 777 nt13.91□□□□□ -0.18
UBP1P25037 VPS75YNL246W 795 nt13.91□□□□□ -0.18
UBP1P25037 YIL100WYIL100W 354 nt13.9□□□□□ -0.18
UBP1P25037 PCM1YEL058W 1674 nt13.89□□□□□ -0.19
UBP1P25037 DAT1YML113W 747 nt13.89□□□□□ -0.19
UBP1P25037 RPM1RPM1 483 nt13.89□□□□□ -0.19
UBP1P25037 AQY1YPR192W 918 nt13.89□□□□□ -0.19
UBP1P25037 SPT5YML010W 3192 nt13.89□□□□□ -0.19
UBP1P25037 YGL034CYGL034C 366 nt13.85□□□□□ -0.19
UBP1P25037 SAM1YLR180W 1149 nt13.83□□□□□ -0.2
UBP1P25037 NDI1YML120C 1542 nt13.83□□□□□ -0.2
UBP1P25037 IRC15YPL017C 1500 nt13.83□□□□□ -0.2
UBP1P25037 YSC84YHR016C 1407 nt13.81□□□□□ -0.2
UBP1P25037 YMR226CYMR226C 804 nt13.8□□□□□ -0.2
UBP1P25037 PAU7YAR020C 168 nt13.76□□□□□ -0.21
UBP1P25037 DCW1YKL046C 1350 nt13.74□□□□□ -0.21
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