Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQE9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQE9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQE9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
U3KQE9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQE9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQE9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
U3KQE9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U3KQE9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U3KQE9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U3KQE9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U3KQE9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U3KQE9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
U3KQE9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U3KQE9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
U3KQE9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
U3KQE9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms