Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRPF3Q9ULD4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRPF3Q9ULD4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms