Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM7Q9UK45 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LSM7Q9UK45 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM7Q9UK45 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms