Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXD3Q9UJU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD3Q9UJU5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD3Q9UJU5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD3Q9UJU5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD3Q9UJU5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms