Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGEF1Q9UJ41 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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