Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDP2Q9P2J9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms