Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HPS4Q9NQG7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPS4Q9NQG7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms