Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYD88Q99836 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYD88Q99836 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYD88Q99836 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms