Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INPP4AQ96PE3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INPP4AQ96PE3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms