Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN7L3BQ96GX2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN7L3BQ96GX2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms