Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX27Q96GQ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX27Q96GQ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms