Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXNL1Q96CM4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms