Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE23Q8NDY6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BHLHE23Q8NDY6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms