Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC82Q8N4S0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC82Q8N4S0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC82Q8N4S0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms