Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RASGEF1CQ8N431 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASGEF1CQ8N431 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGEF1CQ8N431 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGEF1CQ8N431 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RASGEF1CQ8N431 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms