Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED8Q8IZ13 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZBED8Q8IZ13 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZBED8Q8IZ13 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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