Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL4Q6XD76 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL4Q6XD76 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL4Q6XD76 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms