Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MLIPQ5VWP3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MLIPQ5VWP3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms