Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT3Q5FWE3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRT3Q5FWE3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRRT3Q5FWE3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRT3Q5FWE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRT3Q5FWE3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRT3Q5FWE3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms