Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK2Q16620 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NTRK2Q16620 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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