Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
EIF3AQ14152 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
EIF3AQ14152 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
EIF3AQ14152 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms