Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTF3Q12996 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSTF3Q12996 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSTF3Q12996 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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