Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NPRL3Q12980 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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NPRL3Q12980 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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NPRL3Q12980 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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NPRL3Q12980 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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NPRL3Q12980 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NPRL3Q12980 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms