Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNEQ04844 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNEQ04844 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms