Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP3M2P53677 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3M2P53677 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms